Le comité se compose de la manière suivante (article 18 des statuts).
- Deux représentants par organisation faîtière cantonale ou régionale. Un des deux représentants doit être un exploitant agricole. En général les présidents et les directeurs des chambres cantonales ou régionales siègent au comité.
- Les deux à quatre sièges restants sont répartis entre les autres membres.
Les conseillers d’Etat ou ministres en charge de l’agriculture peuvent participer comme invités aux séances du comité. Ils peuvent se faire représenter par un membre de l’administration cantonale.